【摘 要】
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选取NCBI基因表达谱数据库中访问号为GSE41439的基因芯片数据集为分析对象,首先利用R软件筛选差异表达基因并绘制成聚类热图,然后将差异基因上传至DAVID数据库进行GO功能与KE
【基金项目】
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江苏省大学生创新创业训练计划一般项目(201910313070Y),基础医学国家级实验教学示范中心(徐州医科大学)资助项目
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选取NCBI基因表达谱数据库中访问号为GSE41439的基因芯片数据集为分析对象,首先利用R软件筛选差异表达基因并绘制成聚类热图,然后将差异基因上传至DAVID数据库进行GO功能与KEGG通路富集分析,接着利用STRING数据库构建蛋白质互作网络,并利用Cytoscape软件进行可视化,以直观地观察蛋白与蛋白之间的相互关系。由蛋白互作网络筛选出4个关键基因:PIK3R1、GNAS、GNAL、GNG4,可对其进行更深入的讨论。此方法适用于多种基因芯片的研究,具有很好的可推广性,将其运用于疾病相关的基因芯片,
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