【目的】观察清热利湿活血方对乙型肝炎病毒（HBV）转基因小鼠的抗病毒作用及对肝组织TANK结合激酶1（TKB1）、干扰素调控因子3（IRF3）表达的影响,以阐明其作用机制。【方法】首先建立清热利湿活血方的HPLC指纹图谱。再将HBV转基因小鼠随机分为4组,即模型组,苦参素组,清热利湿活血方高、低剂量组,每组8只。苦参素组小鼠给予灌胃剂量为0.15 g·kg^-1·d^-1的苦参素混悬液,清热利湿活血方高、低剂量组小鼠分别给予灌胃剂量为7、2 g·kg^-1·d^-1的清热利湿活血方混悬液,给药共5周。治疗结束后,采用酶链免疫吸附法（ELISA）检测血清及肝组织乙型肝炎病毒表面抗原（HBsAg）,采用常规苏木素—伊红（HE）染色观察肝组织病理变化,采用定量聚合酶链反应（qPCR）法检测血清中HBV DNA及肝组织中HBV DNA、TKB1 mRNA、IRF3 mRNA表达,采用蛋白免疫印迹（Western blot）法检测肝组织TKB1、IRF3的蛋白表达。【结果】标定14个特征峰构成清热利湿活血方的指纹图谱,其中1号峰为没食子酸,8号峰为柯里拉京,9号峰为虎杖苷,10号峰为鞣花酸,13号峰为甘草酸,14号峰为齐墩果酸。高剂量清热利湿活血方可减轻肝细胞轻度脂肪变性、肝细胞轻度水肿及Kuffer细胞增生等病理改变,显著降低HBV转基因小鼠肝脏和血清中的HBsAg、HBV DNA水平（P<0.05或P<0.01）,显著增强小鼠TKB1、IRF3的mRNA及蛋白表达水平（P<0.05或P<0.01）。【结论】清热利湿活血方有抗HBV作用,其抗病毒机制可能与增强TKB1、IRF7 mRNA及蛋白表达,进而影响干扰素分泌有关。