《中华人民共和国渔业法》和《中华人民共和国海域使用管理法》分别规定了养殖许可和海域使用的相关程序,但在实践中,两法在对于养殖活动的管理方面却发生了重叠与冲突。本应属于《中华人民共和国渔业法》规定的养殖权在司法实践中照准的却是《中华人民共和国海域使用管理法》并收取海域使用金。这种两权并存的解释方法不但违反了物权法中的基本原则,也引发了一系列的渔业管理问题与民事纠纷。通过对中国渔业权与海域使用管理体系概要梳理,分析渔业权与海域使用权存在的违反"一物一权"原则、受渔业权内部差异性制约、渔业权与海域使用权客体适用范围不一致和渔业资源隶属关系不明确等立法冲突,以及由此衍生的高价拍卖海域使用权侵害渔民利益、不合理收取使用金加重渔民负担和某些地方政府强制征海缺乏合理补偿等问题。针对存在的问题,在归纳分析保留海域使用权,拆分渔业权;保留渔业权,拆分海域使用权两种协调渔业权与海域使用权冲突构想的基础上,提出对海域使用权进行细化改造;建立入渔权体系,完善海域征收补偿机制等协调渔业权与海域使用权冲突的具体改良措施建议。以期为中国海域治理提供更加合理、科学的改革建议。