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新疆蒙马拉铅锌矿大地构造位置属博罗科努古生代复合岛弧带内，该区在奥陶纪一石炭纪，受准噶尔大洋板块往南部伊犁微板块俯冲的影响，形成古生代复合岛弧带，火山一侵入岩带特征明显，在泥盆纪一石炭纪期间，火山活动和岩浆侵入广泛发育，为海相火山岩型铅锌矿床的成矿提供了条件，矿体赋存于下石炭统大哈拉军山组的海相火山角砾岩中。