【摘 要】
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目的提出一种基于网络相似性算法的lncRNA-miRNA相互作用预测新方法。方法在lncRNASNP2、LNCipedia、miRBase、NONCODE、microRNA、miRTarBase 7.0数据库中筛选lncRNA-miRNA互作关系及lncRNA和miRNA的序列、表达谱、功能数据后,应用Needleman-Wunsch算法分析lncRNA和miRNA的序列相似度并整合到不同的相似度矩阵中,最终使用NSILMI模型处理并得到预测的lncRNA-miRNA互作得分。结果当α为0.7时,基于序列
【机 构】
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辽宁大学生命科学院,辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程技术研究中心,辽宁省药物分子模拟与设计工程实验室
【基金项目】
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辽宁省教育厅科学研究经费项目(青年科技人才“育苗”项目)(LQN201906)。
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目的提出一种基于网络相似性算法的lncRNA-miRNA相互作用预测新方法。方法在lncRNASNP2、LNCipedia、miRBase、NONCODE、microRNA、miRTarBase 7.0数据库中筛选lncRNA-miRNA互作关系及lncRNA和miRNA的序列、表达谱、功能数据后,应用Needleman-Wunsch算法分析lncRNA和miRNA的序列相似度并整合到不同的相似度矩阵中,最终使用NSILMI模型处理并得到预测的lncRNA-miRNA互作得分。结果当α为0.7时,基于序列
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