【摘 要】
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在构建蛋白质相互作用网络时从通路数据出发,利用通路数据整合蛋白质相互作用网络。提出了一个基于随机游走的蛋白质功能预测方法,在该算法中把已知功能的蛋白质当作起始点,
【机 构】
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黑龙江大学计算机科学技术学院,山东航天电子技术研究所
【基金项目】
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黑龙江省自然科学基金资助项目(F201248)
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在构建蛋白质相互作用网络时从通路数据出发,利用通路数据整合蛋白质相互作用网络。提出了一个基于随机游走的蛋白质功能预测方法,在该算法中把已知功能的蛋白质当作起始点,对于随机游走在蛋白质互作网络中产生的邻居信息,转换为注释模式信息,并根据已知功能的蛋白质的功能来提取未知功能蛋白质的注释模式。利用传统的K近邻算法从训练样本集中找到未知功能蛋白质的k个最近邻。最后,结合多标签分类的K近邻算法,统计k个近邻中蛋白质的功能类数目,基于最大后验概率预测未知功能蛋白质属于的功能标签类。通过在构建蛋白质互作网络进行实验,结
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