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在高等院校R&D支出与专利申请之间关系研究的基础上,采用负二项分布对中国29个省、直辖市的高等院校14年(1990-2003)的R&D支出与专利申请量以及论文发表数的研究发现,中国高等院校投入与产出的直接关系非常弱,R&D支出的促进效果很不明显.政府需要借鉴其他国家对高等院校知识产权保护的相关政策,增加中国高等院校技术成果的产出率.