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目的：比较脱细胞异体真皮基质填塞与切开挂线术在肛瘘患者中的治疗效果。方法选取2013年5月至2015年2月湖南中医药大学第一附属医院收治的肛瘘患66例者，根据患者入院顺序及患者意愿分为观察组和对照组，每组33例。观察组患者采用脱细胞异体真皮基质填塞治疗，对照组患者采用切开挂线术治疗，比较两组患者的治疗效果。结果观察组患者的并发症发生率为3.0%，对照组为18.2%，观察组并发症发生率明显低于对照组，差异有统计学意义（P＜0.05）；两组患者均无复发病例。结论脱细胞异体真皮基质填塞术治疗肛瘘患者效果非常理想，患者并发症发生率低，无复发。