【摘 要】
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采用分子生物学的方法(定性/定量PCR、克隆文库)对洞庭湖岸边带沉积物中氨氧化古菌(Ammonia-Oxidizing Archaea,AOA)进行分子水平的多样性和丰度分析,并结合硝化速率潜势(Pot
【机 构】
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中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室; 中国科学院大学; 哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金(No.21077119);国家重点基础研究发展(973)计划项目(No.2009CB421103);环境模拟与污染控制国家重点联合实验室专项经费项目(No.12L03ESPC);北京市科技新星计划项目(No.2011095);香港王宽诚教育基金~~
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采用分子生物学的方法(定性/定量PCR、克隆文库)对洞庭湖岸边带沉积物中氨氧化古菌(Ammonia-Oxidizing Archaea,AOA)进行分子水平的多样性和丰度分析,并结合硝化速率潜势(Potential Nitrification Rate,PNR)剖析AOA在洞庭湖岸边带沉积物中氨氧化的作用.采用实时荧光定量PCR技术对氨氧化古菌AOA和氨氧化细菌(Ammonia-Oxidizing Bacteria,AOB)进行靶向amoA基因(氨氧化关键功能基因)的定量分析,发现古菌amoA基因的丰度为1.49×107～1.97×108copies·g-1(以干土计),高于细菌amoA基因丰度(1.52×104～2.45×106copies·g-1,以干土计)1～4个数量级.洞庭湖岸边带沉积物硝化速率潜势为1.11～6.47nmol·g-·1h-1(以N计),比细胞硝化速率为0.55～1.68fmol·cell-·1d-1(以NH3计).硝化速率潜势与古菌amoA基因丰度之间呈现正向变化趋势,而与细菌amoA基因丰度呈负向变化趋势,指示了低氨氮环境下AOA在氨氧化过程中的主导作用.生物多样性分析表明,经酶切分型后得到的22个古菌amoA基因序列以97%的相似度划分为8个独立操作单元(Operational Taxonomic Unit,OTU).系统发育分析显示,OTU1～6(14个序列)属于第一分支,OTU7～8(8个序列)属于第二分支,且均属于一个新命名的古菌类群--奇古菌门(Thaumarchaeota).
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