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高等教育发展高水平与经济发展低水平之间的矛盾、高等教育投入地方化与教育效益外溢化的矛盾、生源地局域化与毕业生去向全国化的矛盾、大学的经营者地位和国家的所有者地位的矛盾、重点高校科技创新职能与非重点高校人才培养职能的矛盾，是陕西省高等教育事业的结构性矛盾。这些矛盾已成为制约陕西省高等教育发展的瓶颈。文章对五个结构性矛盾做了分析研究，并提出了应提高财政支出中的高等教育比例，建立其他省份对陕西省的人才培养费用补偿机制，适度提高学费在高等教育成本中的比例等解决对策。