【摘 要】
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为探究藏药细果角茴香转录组中简单重复序列位点信息,本研究利用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台,RNA-Seq测序技术对藏药细果角茴香植株进行测序,并采用生物信息学MISA数据分析进行拼接后查找SSR位点.细果角茴香转录组测序共获得27979个重复单元长度为2～6个碱基的微卫星重复序列,总的SSR碱基数为142108085bp,平均每3.1kb出现1个SSR位点.细果角茴香SSR中主要重复单元类型为三碱基,占SSR总数的68.34％,在统计的213种重复类型中(AAG/CTT)n所占
【机 构】
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中国科学院西北高原生物研究所,中国科学院藏药研究重点实验室,西宁,810008;中国科学院大学,北京,100049;中国科学院西北高原生物研究所,中国科学院藏药研究重点实验室,西宁,810008
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为探究藏药细果角茴香转录组中简单重复序列位点信息,本研究利用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台,RNA-Seq测序技术对藏药细果角茴香植株进行测序,并采用生物信息学MISA数据分析进行拼接后查找SSR位点.细果角茴香转录组测序共获得27979个重复单元长度为2～6个碱基的微卫星重复序列,总的SSR碱基数为142108085bp,平均每3.1kb出现1个SSR位点.细果角茴香SSR中主要重复单元类型为三碱基,占SSR总数的68.34％,在统计的213种重复类型中(AAG/CTT)n所占比例最高为(7773,27.78％),其次是(AG/CT)n(4735,16.92％)和(ATC/ATG)n(2420,8.65％),藏药细果角茴香转录组中SSR位点分布频率较高,重复单元类型丰富.研究首次基于细果角茴香转录组高通量测序数据开发了SSR分子标记,为细果角茴香遗传连锁图谱、DNA指纹图谱、遗传多样性评价、种植资源收集与鉴定和分子标记辅助育种等工作提供了科学基础.
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为更好保存红花龙胆种质资源及研究其次生代谢产物,需建立高效的红花龙胆愈伤组织诱导体系,并对愈伤组织的生理生化特性展开研究.本研究利用植物组培技术,筛选红花龙胆愈伤的最佳外植体,运用响应面优化法对红花龙胆愈伤组织诱导体系进行优化,对愈伤组织继代培养过程中的生理生化指标(细胞活力,生长周期,可溶性蛋白含量和苯丙氨酸解氨酶活性)进行检测.结果显示,适合红花龙胆愈伤组织诱导的最佳外植体是根;愈伤组织诱导最佳培养基:MS+NAA 0.87 mg/L+6-BA 0.43 mg/L+KT 0.71 mg/L,诱导率97
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