【摘 要】
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目的 对云南省鼠疫菌株进行基因分型,探究云南各型菌株之间的内在联系.方法 选取云南家鼠、野鼠及玉龙鼠疫菌共171株进行试验,采用鼠疫菌基因组23个差异片段(DFR)进行分型,并运用BioNumerics 5.0进行聚类分析.结果 23个差异片段将171株鼠疫菌分为7个基因组型:Genomovar5、Genomovar7、Genomovar9型及4个新发现的基因型.7株玉龙型菌株都为Genomova
【机 构】
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云南学院公共卫生学院,671000大理,云南省地方病防治所云南省鼠疫防控技术重点实验室,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室,671000大理,云南省地方病防治所云南省鼠疫防控技术重点实验室
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目的 对云南省鼠疫菌株进行基因分型,探究云南各型菌株之间的内在联系.方法 选取云南家鼠、野鼠及玉龙鼠疫菌共171株进行试验,采用鼠疫菌基因组23个差异片段(DFR)进行分型,并运用BioNumerics 5.0进行聚类分析.结果 23个差异片段将171株鼠疫菌分为7个基因组型:Genomovar5、Genomovar7、Genomovar9型及4个新发现的基因型.7株玉龙型菌株都为Genomovar5基因型;16株野鼠型(滇西纵谷型)鼠疫菌株被分为3个基因型,其中13株为Genomovar7基因型,2株为Genomovar9基因型,1株为新发现的Genomovar-yn1基因型;148株云南家鼠型(滇闽居民型)鼠疫菌株被分为4个基因型,其中145株为Genomovar9基因型,3株为3个新发现的基因型,分别为Genomovar-yn2、-yn3、-yn4基因型.生态型聚类分析显示,玉龙型鼠疫菌株与滇西纵古型(野鼠型)菌株的基因型较为相似(87.20%),与滇闽居民型(家鼠型)相似度较小(73.75%).2株滇西纵谷型菌株与滇闽居民型的主基因型同为Genomovar9基因型.滇西纵谷型Genomovar-yn1基因型与Genomovar7基因型相似,但缺失DFR11.滇闽居民型Genomovar-yn2、-yn3、-yn4基因型与Genomovar9基因型相似,但分别缺失了DFR10、DFR9、DFR 11.结论 在野鼠型鼠疫菌株中新发现了1种基因型,在家鼠型鼠疫菌株中新发现了3种基因型,在野鼠型鼠疫菌株中发现了家鼠型鼠疫菌株.玉龙鼠疫菌株的基因型与滇西纵谷型(野鼠型)菌株的基因型相似较高,与滇闽居民型(家鼠型)菌株的基因型相似度较小。
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