冠心宁是由丹参和川芎组成的现代中药制剂，具有活血化瘀、通脉养心的功效。临床研究表明其对于缺血性脑卒中具有一定的治疗作用，但具体机制尚未阐明。该研究采用转录组学探讨冠心宁抗小鼠脑缺血再灌注损伤的潜在作用机制并进行体外验证。采用大脑中动脉栓塞法（middle cerebral artery embolization，MCAO）构建小鼠脑缺血再灌注损伤模型，以小鼠神经功能评分、脑梗死面积、病理学形态、神经元损伤、细胞凋亡为指标，考察冠心宁对小鼠脑缺血再灌注损伤的药效作用。结果显示，冠心宁可以降低脑缺血再灌注损伤小鼠神经功能评分，减轻脑梗死面积，改善脑组织病理学形态、神经元损伤及细胞凋亡。通过RNA-seq技术对小鼠脑组织RNA样本进行测序，以|log2FC|>1、P<0.05为条件筛选差异表达基因，对297个共同差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，提示炎症反应、氧化应激、能量代谢、细胞凋亡是冠心宁抗小鼠脑缺血再灌注损伤的潜在作用机制。体外实验结果表明，冠心宁可下调p-NF-κB p65和p-p38 MAPK蛋白表达、上调PPARγ和PGC-1α蛋白表达，从而抑制TNF信号通路、激活PPAR信号通路，进而抑制炎症反应和改善氧化应激对缺氧复氧损伤SH-SY5Y细胞起到保护作用。该研究初步揭示了冠心宁抗小鼠脑缺血再灌注损伤的作用机制，为冠心宁的临床应用提供参考依据。