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以海南陵水、西沙、南沙以及马来西亚4个地理区域的101尾波纹唇鱼作为研究对象，利用mtDNA控制区序列对波纹唇鱼进行了遗传多样性分析，并通过扩增、克隆与序列测定技术，获得了mtDNA控制区905bp的序列，其多态性遗传参数的统计显示，在101尾个体中存在110个变异位点和71个单倍型；总群体的单倍型多样性（Hd）为0．981，核苷酸的多样性指数（Pi）为0．00579，表明其遗传多样性处于较低水平．Tajima’s D中性检测均为负值，Fst值属于较低水平，仅为0．03195，分子方差分析（AMOVA）和