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土都日打铅锌矿大地构造位于扬子准地台（Ⅰ）、上扬子台褶带（Ⅱ）、凉山陷褶束（Ⅲ）、宁南凹褶束（Ⅳ）南端之干田里平缓褶皱区。区内褶皱、断层构造发育，矿体呈似层状、透镜状和脉状，产于奥陶系中统大箐组（02d）碳酸盐岩层的节理裂隙内、层间破碎带以及小背斜倾末端。围岩蚀变主要有重晶石化、硅化、碳酸盐化、碳化、褐铁矿化、黄铁矿化、方解石化等。成矿受岩相、岩性控制，后期经热液叠加或改造富集，其成因为沉积一中低温热液改造型矿床。