基于生成对抗和卷积神经网络的蛋白质二级结构预测

来源 :计算生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:weiqiangting
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
在生物信息学领域,对于蛋白质二级结构预测是一项具有挑战性的任务,对于确定蛋白质的结构和功能有着极其重要的意义。本文融合了生成对抗网络和卷积神经网络模型进行蛋白质二级结构预测,首先利用生成对抗网络提取蛋白质特征,其次将生成对抗网络提取的特征结合PSSM矩阵作为卷积神经网络的输入,得到预测结果。在测试集CASP9,CASP10,CASP11,CASP12,CB513和PDB25获得了87.06%,87.24%,87.31%,87.39%,88.13%和88.93%,比单独使用卷积神经网络提高了3.88%,4.
其他文献
目的探讨基质金属蛋白酶(MMP)-2及其抑制物(TIMP-2)与转化生长因子(TGF)-β1及其Ⅰ型受体(TGF-β1RⅠ)在乳腺癌组织中的表达及其相关性。方法应用免疫组化SP法检测80例乳腺癌组织中的
目的研究慢性粒细胞白血病(CML)患者血清碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)、基质金属蛋白酶(MMP-2)水平及二者的相关性。方法应用酶联免疫吸附法检测39例CML患者的血清bFGF及MMP-2,并追
1999年1月~2006年1月,我们采用离断性肾盂输尿管成形术治疗婴幼儿重度肾盂积水36例,疗效满意。现报告如下。临床资料:选择山东大学齐鲁医院住院的重度肾盂积水婴幼儿36例,男15例、
目的探讨不同移植方式对恶性血液病的疗效。方法对30例恶性血液病患者施行造血干细胞移植(HSCT),其中自体HSCT(Auto-HSCT)14例,同基因HSCT(Syn-HSCT)2例,异基因HSCT(AIM-HSCT)14例。预处
通过对引进的4个品种开展种植试验,希望筛选出适合北海种植的秀珍菇品种。结果表明,秀珍P2的产量和生物转化率最高、出菇集中、病虫害感染情况少,其产品消费者也喜欢,在生产
许多传统游戏具有浓烈的地方特色和生活童趣,能满足不同年龄、性别和不同性格儿童的需要,深受儿童喜爱。为了挖掘其价值,笔者开始尝试把传统体育游戏“贴人”引入班级的户外活动
【关键词】 新课程;教师;备课;教材;方法;标准  【中图分类号】 G633.3 【文献标识码】 A  【文章编号】 1004—0463(2015)20—0075—01   备好课是上好课的前提。过去是就教材而备教材,强调教师怎么“教”,学生就怎么“学”,多是以教师的“解读”牵动或代替学生的“解读”,可以说学生是接受式的学习。新课程理念指出:课堂教学是师生共同建构的过程,强调在合作互助中学习,特
【关键词】 小学语文;高效课堂;素质;备课;  方法;作业  【中图分类号】 G623.2 【文献标识码】 A  【文章编号】 1004—0463(2015)21—0071—01   高效课堂教学是指班级授课的高效率、高效益、高效果。从课程改革的角度讲,是指在班级授课中实现新课程三维目标:知识与技能、过程与方法、情感态度价值观落实的最优化。在课堂上,教师要使学生克服各种惰性,提高课堂活动中师生教
分别应用灯盏细辛注射液(观察组)、复方丹参注射液(对照组)治疗高黏血症患者,观察两组治疗前后的血液流变学、血脂等指标,并进行比较。结果与治疗前及对照组治疗后比较,观察组全血黏
【关键词】 数学教学;分数应用题;困惑;对策  【中图分类号】 G623.5 【文献标识码】 A  【文章编号】 1004—0463(2015) 16—0079—01   分数应用题是重要的教学内容,教师们也尝试把自主、合作、探究的教学理念运用于课堂教学之中,让学生在教师的引导下有更多的时间与空间去自主发现问题,主动解决问题,在合作的愉悦情绪中积极地创新。但实践中仍存在各种问题与困惑,下面笔者就