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过氧物酶体多功能酶(包括I型,Ⅱ型,简称MFE1,MFE2)在哺乳类动物的脂类代谢中发挥其重要作用,MFE1具有2-烯酰CoA水合酶1和(3S)-羟脂酰CoA脱氢酶的活性,而MFE2具有2-烯酰CoA水合酶2和(3R)-羟脂酰CoA脱氢酶的活性,两者均催化烯酰CoA在过氧化物酶体β-氧化径中的第2步和第3步应,MFE1与MFE2的氨基酸序列不具有任何同源性,并且它们的底物特异性也不相同,比较哺乳类MFE1及酵母MFE2发现,哺乳类MFE2羧基末端带有由125个残基组成的固醇载体蛋白2(简称SCP2)结构域