樱花MYB转录因子家族全基因组鉴定与分析

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本研究利用钟花樱转录组测序结果,建立钟花樱的数据库,从中筛选MYB类型的转录因子,并利用生信分析方法对其蛋白分子量、等电点、亲水系数与脂溶性、亚细胞预测位置、蛋白二级结构、基因在染色体上分布的位置、基因序列结构、保守序列和进化关系等展开研究,解析MYB转录因子在钟花樱生长发育过程中的生物学功能。结果表明,本研究中的171个MYB转录因子,大部分为不稳定的亲水性蛋白,其氨基酸数目在74到1 037个之间,分子量在8 530.15到113 977.49之间,等电点在4.34到11.16;生物大分子在细胞内的预测的位置结果表明,共有64个MYB基因定位于核,89个定位于细胞质;蛋白二级结构结果显示,大部分成员的二级结构主体是α-螺旋和无规卷曲;钟花樱MYB基因家族成员中有167个分布在8条染色体上,其余4个成员游离在染色体之外;通过与拟南芥的MYB转录蛋白的序列进行进化分析,将其分为21个亚组;基因结构和motif分析显示,同一亚组的家族成员,其基因序列结构排布的方式和蛋白保守序列排列的方式有很强的相似性。本研究的结果为后续关于钟花樱MYB转录因子家族成员的功能验证做了铺垫,也为其他物种MYB转录因子家族的研究提供了一定的理论支持。
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