荣昌猪初产繁殖性状的全基因组关联研究

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sima1969
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
旨在鉴定荣昌猪初产繁殖性状的重要变异位点和基因,为荣昌猪繁殖性状的遗传改良提供重要的分子标记和基因资源。本研究选取429头荣昌母猪进行猪50K芯片基因分型,经过质量控制和基因型填充后,保留35 046个SNPs用于分析。采用主成分分析法研究群体结构,利用混合线性模型(mixed-linear model, MLM)将出生年、出生月作为固定效应,将主成分值作为协变量对总产仔数、活产仔数、死胎数和初生窝重性状进行全基因组关联分析(GWAS)。结果显示,在全基因组显著水平上鉴定出2个影响荣昌猪初生窝重的SNPs和1个影响荣昌猪死胎数的SNP;在潜在显著水平上鉴定到5个影响荣昌猪总产仔数的SNPs, 3个影响荣昌猪活产仔数的SNPs和10个影响荣昌猪死胎数的SNPs。通过全基因组关联分析筛选到1个显著的SNP(SSC17:57 315 180 bp)同时影响荣昌猪总产仔数、活产仔数和初生窝重,1个显著的SNP(SSC1:279 214 647 bp)同时影响荣昌猪活产仔数和总产仔数,暗示基因在不同性状间具有一因多效性。本研究根据候选基因的相关分子生物学功能,确定BMP7基因为影响荣昌猪总产仔数、活产仔数和初生窝重的重要候选基因,MSH3和CBLB基因为影响荣昌猪死胎数的重要候选基因。以上结果为荣昌猪繁殖性状提供了重要的遗传变异位点和候选基因,也为荣昌猪繁殖性状的基因组选择提供了重要的理论基础。
其他文献
<正> 今天的计算机已经可以做许多复杂的工作,人们对它的神奇功能惊叹不已。可是,假如有人说,现在的计算机还比不上普通的小虫聪明,你会相信吗? 事实的确是这样的。计算机对数学问题的计算、对系列指令的执行,可以说毫不费力,但在联想、理性决策以及适应新环境等方面,计算机却一筹莫展,它需要别人牵着鼻子才能干活。
期刊
《寻找太阳升起的地方》是作曲家陈勇先生具有代表性的声乐作品,也是云南本土音乐创作中一首非常经典的艺术作品。笔者作为高校声乐教师,也作为该艺术歌曲的首唱者,对这首作品的演唱有一定的舞台实践经验与体会。本文将结合《寻找太阳升起的地方》的音乐特征与个人演唱分析给声乐学习者一些建议和帮助,对这首作品的演唱有更好的把握。
斯特鲁伽茨基兄弟的科幻创作历程呈现出与苏联科幻小说传统中乌托邦根源的创造性对话,潜藏着作家借科幻之外衣向人文主义问题的哲学性发问,其核心命题之一是“人与自然”关系的变化及与此相伴的“人的危机”。围绕“人与自然”的讨论隐含在斯氏兄弟包罗万象的时空构建中:他们站在60-80年代的苏联社会生活语境中眺望远处与未来,生发出关于现代与未来、苏联与世界、文学空间与现实空间的多重想象。在这些交错空间的背后,是“
作为新冠肺炎定点收治医院,在人员配置、流程管理、工作机制、体系建设等疫情防控管理工作中积累了一些实践经验,但同时也发现一些问题。通过总结医院在2022年3月新冠肺炎医疗救治工作中的经验及对疫情防控管理存在的主要问题进行梳理,提出了加强人力资源储备、优化应急流程管理、建立防控总结机制、完善应急体系建设等对策思考,以便于医院今后进一步优化整合应急管理体系,提高应急管理能力。
目的 分析某三级综合医院全年日间手术实施现状,为下一步进行相关研究提供参考和基线数据。方法 通过医院信息系统采集2019年1月1日-2019年12月31日日间手术患者病案首页数据共11 616例,剔除不适用数据,保留有效数据量11 371例;采用Excel建立数据库,对日间手术患者基本情况采用频数、率等指标进行描述性分析;对于日间手术患者费用的影响因素采用SAS 9.4统计软件进行单因素分析和回归
为筛选猪总产仔数和产活仔数性状关键SNP分子标记或候选基因,采用Illumina porcine 50K芯片对同一猪场186头加系大白猪能繁母猪开展了全基因组SNP扫描,后又对扫描结果进行了质量控制、Beagle填充和SNP基因型分型,结合这些试验猪的表型性状测定和群体结构分析结果,进行全基因组关联分析(GWAS)。群体结构分析结果表明,试验所用的加系大白猪样本未出现群体分层现象;在18对(36条
现阶段,基层医疗机构新冠疫情的防控工作重点在于做好常态化门急诊预检分诊制度及发热病人的转诊上报登记等工作、常态化落实好防院感各项防控措施,常态化做好中高风险区重点人员的随访和管理等相关工作,准确及时进行全员核酸检测和次密接人员采样管理工作,统筹做好新冠疫苗应种尽种工作,以及中高风险区人员及密切接触者的流调工作。在对疫情防控中的具体方法和措施进行复盘的过程中,其防控措施有效性和存在的问题也逐步展现。
期刊
目的 应用生物信息学方法分析程序性细胞死亡分子10(PDCD10)基因在胰腺导管腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系。方法 搜索GEPIA数据库中关于PDCD10基因的数据,分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的表达水平及其与患者生存情况的关系。应用UALCAN数据库分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的甲基化水平。应用LinkedOmics数据库分析胰腺导管腺癌组织中与PDCD10基因共