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真核细胞内细胞器的酸性环境是内吞作用、溶酶体酶分泌等生理活动的重要条件，液泡三磷酸腺苷酶（ vacuolar ATPases， V-ATP）和氯离子通道（ chloride channel， CLC）家族在真核细胞内各种膜性结构及质膜上广泛分布，它们参与和调节囊泡内的酸化作用，文章对V-ATP酶和CLC蛋白的分布、结构、作用机制及生理病理意义作一综述。