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提出了一种基于有穷自动机的解决哈密顿路径问题的DNA算法，将有穷自动机的状态用含有DNA限制性内切酶的识别位点的DNA双链分子来编码，通过限制性内切酶的生物化学反应来实现状态的转移。算法的创新之处在于用DNA计算模拟有穷自动机的运行过程中，保留了其经过的各个状态，以便最后筛选出经过各个顶点的路径。算法的优点是实验实现简易，大大减少所使用的DNA分子的数量。