基于生物信息学的溃疡性结肠炎免疫细胞的浸润模式分析

来源 :中国免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhjie1977
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目的:分析溃疡性结肠炎(UC)的免疫细胞浸润情况。方法:从GEO数据库下载GSE11223微阵列测序数据集,样本通过Agilent-012391全人类基因组Oligo微阵列测序,利用R软件和免疫细胞浸润估计分析工具——反卷积算法(CIBERSORT),全面分析UC免疫浸润细胞。22个免疫细胞亚群的比例被评估,免疫浸润在配对正常组织和UC组织之间存在显著差异,这种差异可以表现为特征个体差异。在研究的细胞亚群中,使用免疫细胞比例进行的无监督聚类分析显示了5个亚群。结果:与正常组织巨噬细胞M2(P=0.014)
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