【摘 要】
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目的:筛选与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的基因,并探究其在OSCC发生、发展中的作用及机制.方法:筛选并纳入癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)数据集下的OSCC肿瘤样本(OSCC组)330例,正常样本(正常样本组)37例,通过生物信息学分析的方法筛选出两组之中差异表达的基因.进一步通过肿瘤T
【机 构】
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湖南中医药大学第二附属医院口腔科,长沙410005;湖南中医药大学第一附属医院口腔科,长沙410007
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目的:筛选与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的基因,并探究其在OSCC发生、发展中的作用及机制.方法:筛选并纳入癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)数据集下的OSCC肿瘤样本(OSCC组)330例,正常样本(正常样本组)37例,通过生物信息学分析的方法筛选出两组之中差异表达的基因.进一步通过肿瘤T分级(T1+T2组为114例,T3+T4组为216例)、转移(阳性组为163例,阴性组为167例)及病理分级(G1+G2组为244例,G3+G4组为86例)分别对其进行分组,分别求得差异基因后取交集,筛选出与OSCC预后相关的差异表达基因.进一步选择差异倍数最大的差异基因[透明质酸介导运动因子受体(hyaluronan mediated motility receptor,HMMR)基因]进行下一步研究,探讨HMMR基因与临床分级(Stage I+II组为69例,StageⅢ+IV组为261例)、T分级、转移及病理分级之间的关系,并根据HMMR基因表达的中位值分为高表达组和低表达组(高表达组为165例,低表达组为165例),采用Kaplan-Meier生存分析探讨HMMR表达的高低与预后相关因子之间的关系.收集2014年1月至2016年1月在湖南中医药大学第一附属医院接受手术治疗的50例OSCC患者的肿瘤组织标本及配对的正常口腔黏膜组织标本,采用real-time RT-PCR、蛋白质印迹法及免疫组织化学等技术对生物信息学的分析结果进行验证,采用Kaplan-Meier生存分析检测HMMR免疫组织化学染色阳性及阴性表达(阳性组为32例,阴性组为18例)与预后之间的关系,采用Cox回归分析模型探讨OSCC预后相关危险因子,再分别通过细胞增殖实验及细胞划痕实验评估下调HMMR表达后对OSCC细胞增殖及迁移能力的影响.结果:在OSCC组织中HMMR呈高表达,且HMMR高表达组的预后相关因子相对于低表达组显著降低,差异均有统计学意义(均P<0.05),HMMR高表达与T分级(RR=1.33,P<0.05)、淋巴结转移(RR=1.74,P<0.05)、临床分期(RR=1.49,P<0.05)显著相关,是OSCC预后的一个独立危险因子(RR=1.45,P<0.05).与下调前相比,下调HMMR后可抑制OSCC细胞的增殖及迁移,差异均有统计学意义(P<0.05或P<0.01).结论:HMMR作为OSCC的一个原癌基因,可促进OSCC的发生、发展,其可能可作为一个潜在的早期诊断标志物及靶向治疗的新靶标.
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