基于RNA-seq技术的活血化瘀法治疗乳腺癌关键基因的筛选和验证

来源 :中国实验方剂学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:abc135abc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究活血化瘀治法(the medicine group of promoting blood circulation and removing stasis,PBCRS)对7,12-二甲基苯蒽[7,12-dimethylbenz(a) anthracene,DMBA]诱发性大鼠乳腺癌的抑制作用,及运用转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-seq)和信号网络分析(ingenuity pathway analysis,IPA)软件筛选关键基因和验证。方法:将96只SD大鼠随机分为空白组,DMBA模型组,枸橼酸他莫昔芬(Tamoxifen,TAM)组(1.9 mg·kg-1·d-1),PBCRS高、中、低剂量组(12.96,6.48,3.24 g·kg-1·d-1)。药物干预1周后,除空白组外,采用DMBA诱导大鼠乳腺癌模型(灌服2次,间隔1周,剂量100 mg·kg-1)。给药10周后,观察大鼠荷瘤重、荷瘤体积变化,用总RNA提取试剂盒提取总RNA,从DMBA模型组和PBCRS中剂量组各取3个RNA样品进行基因检测,筛选出关键差异基因,用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)验证关键基因。结果:与DMBA模型组比较,PBCRS中剂量组荷瘤重和荷瘤体积均明显降低(P<0.05),PBCRS高、低剂量组荷瘤重和荷瘤体积虽有降低,但与DMBA模型组比较差异均无统计学意义;基于RNA-seq技术及IPA分析软件筛选出果糖1,6二磷酸酶1 (fructose-1,6-bisphosphatase1,FBP1),浦肯野细胞蛋白4(purkinje cell protein 4,PCP4),肌红蛋白(myoglobin,MB) 3个关键基因;与DMBA模型组比较,PBCRS高、中剂量组FBP1 mRNA表达均明显升高(P<0.05),PBCRS低剂量组FBP1 mRNA表达升高,但差异无统计学意义,PBCRS高、中、低剂量组PCP4 mRNA的表达增高,但无统计学差异,PBCRS低剂量组MB mRNA的表达虽降低,差异无统计学意义。结论:PBCRS可能通过干预乳腺癌组织中FBP1的表达,抑制乳腺癌的发生。
其他文献
激光焊接与传统点焊相比有诸多优势,目前已经成为发达国家汽车制造业中普遍应用的成熟工艺。而我国在这方面的应用研究较少。关于机器视觉的理论研究已经较为透彻,但是实践经
<正>教育出版人有着既能脚踏实地、又会仰望星空的优良传统,在变革凶猛的今天,理应积极求变,在变中求胜、求发展,若是只顾低头拉车,不管抬头看路,走着走着,很可能就会发现没
文化创意产业是信息时代知识经济的产物,近些年来,大连市文化的创意产业成长速度十分迅猛,从整体上来看,产业的规模持续扩大,就业形势逐渐良好稳定。但是大连市创意产业生产
当今时代,已进入以读者为主的"自有媒体"时代。微博、微信的出现深刻地改变着我们的工作和生活方式,也改变着传统的新闻传播方式。找准自身的核心价值,通过互动、沟通、服务,
为利于农业、牧业、林业的迅速发展,近年来我国对于水利水电工程加大了投资力度。为使这部分国家建设资金得到最大化的合理利用,就应该有合理的工程造价,尤其是想要使这部分
本研究以菜籽饼粕饲料为研究对象,采用化学法建立了菜籽饼粕饲料猪消化能及养分消化率预测模型,并根据动物的实测值对仿生消化法的可行性进行了验证。试验一化学法建立菜籽饼
研究目的:观察耳穴贴压配合补液法治疗脾胃虚弱型妊娠恶阻的临床疗效,并探讨其作用机理,为临床推广提供理论依据。研究方法:本研究选择自2009年12月至2011年3月于黑龙江中医药
嘉宾:诸大建(同济大学可持续发展与管理研究所所长、上海市政府决策咨询特聘专家)$$“城市应尽可能为市民生活提供便利,但是,扔垃圾这件事是一个例外。如果市民扔垃圾太‘方便’,整
报纸
在这样一个出版"寒冬"呼啸的年度里,如果要挑出一部真正的畅销书的话,《德川家康》应该可以担此重任,这部550万字的大部头历史小说,持续出了一年才出齐,截至2008年年末,累计