【摘 要】
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为探讨青篱柴转录组中简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)位点信息,开发青篱柴分子标记技术,采用高通量测序技术获得青篱柴转录组原始试验数据,经过生物信息学软
【机 构】
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贵州师范大学生命科学学院,贵州省植物生理与发育调控重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(编号:31560184、31300317)
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为探讨青篱柴转录组中简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)位点信息,开发青篱柴分子标记技术,采用高通量测序技术获得青篱柴转录组原始试验数据,经过生物信息学软件Trinity拼接后,获得66755条单基因簇(universal gene,简称unigene)。进一步采用生物信息学分析软件MISA对所有的unigene进行SSR位点数据挖掘。共计搜索出22542个SSR位点,分布在18972条unigene中,出现频率为33.77%,发生频率为28.42%,SSR平均长度为1
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