【摘 要】
：
目的 为了探知宁夏枸杞Lycium barbarum花药发育过程及挖掘花药发育相关基因.方法 以单双核花粉时期和成熟花粉时期的花药为研究材料,通过高通量Illumina HiSeq2500测序平台进行转录组分析.结果 组装共获得128151条Unigene,将Unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库(non-redundant protein databasse,NR)、去冗余的蛋白序列数据库(Swiss prot protein database,Swiss-Prot)、基因本体数据库(gene o
【机 构】
：
宁夏大学生命科学学院,西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室,宁夏银川750021;宁夏枸杞产业发展中心,宁夏银川750021;中宁县杞鑫枸杞苗木专业合作社
论文部分内容阅读
目的 为了探知宁夏枸杞Lycium barbarum花药发育过程及挖掘花药发育相关基因.方法 以单双核花粉时期和成熟花粉时期的花药为研究材料,通过高通量Illumina HiSeq2500测序平台进行转录组分析.结果 组装共获得128151条Unigene,将Unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库(non-redundant protein databasse,NR)、去冗余的蛋白序列数据库(Swiss prot protein database,Swiss-Prot)、基因本体数据库(gene ontology,GO)、直源同源群集数据库(clusters of orthologous groups,COG)、真核同源群数据库(euKaryotic orthologous groups,KOG)、基因功能和代谢途径数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库比对,共有40140条得到注释.在错误发现率(false discovery rate,FDR) ＜0.05且差异倍数(fold change,FC)≥2的条件下,单双核花粉时期与成熟花粉时期的差异表达基因共有46个.KEGG注释发现有4个差异表达基因参与甘油酯代谢、亚油酸代谢、苯丙氨酸代谢和苯丙烷类生物合成4个途径中.富含亮氨酸重复蛋白、细胞周期蛋白、类受体蛋白激酶、E3泛素蛋白连接酶等11个差异表达基因参与了花药发育过程.随机选取其中5个差异表达基因进行qRT-PCR验证,表达结果与转录组数据基本一致,表明其数据真实可靠.结论 为进一步解释宁夏枸杞花药发育的相关分子机制奠定了基础,也为后续研究宁夏枸杞花药发育的生物学特征提供了有益的基因资源.
其他文献
目的 揭示蟾酥提取物对大鼠胸主动脉血管环舒缩的双向调控作用及潜在效应成分组成.方法 利用离体生物能量信号采集系统,评价蟾酥提取物及其水洗脱部位和70％乙醇洗脱部位对大鼠胸主动脉血管环的舒缩调控作用;并在此基础上,建立UHPLC-Q TOF-MS/MS联用方法,对各样品进行成分解析;根据成分鉴定结果,逐一考察其中主要成分的血管调控效应.结果 蟾酥提取物对静息状态下的大鼠胸主动脉血管环表现出先收缩后舒张的双向调控作用;而其水洗脱部位仅表现出血管收缩效应,70％乙醇洗脱部位仅表现出血管舒张效应.进一步研究发现,
目的 研究补阳还五汤合参芪地黄汤化裁对糖尿病肾病小鼠肾小管间质纤维化的作用及机制.方法 取8只db/m小鼠作为对照组,16只db/db小鼠随机分为模型组和中药组,给予补阳还五汤合参芪地黄汤化裁干预12周,留尿,检测各组小鼠尿白蛋白/肌酐比值(albumin/creatinine ratio,ACR);取肾组织,进行苏木素-伊红(HE)、高碘酸希夫(PAS)和天狼猩红(Pmicrosirius-Red)染色,检测肾组织病理损伤和纤维化程度;采用免疫组化法检测肾组织α-平滑肌肌动蛋白(α-smooth mus
目的 建立天南星化学成分的含量测定方法,比较炮制前后的含量变化,研究炮制过程中含量变化的规律.方法 分别采用扫描电子显微镜、UV、HPLC、BCA蛋白浓度测定试剂盒对天南星炮制前后的草酸钙针晶的形态,草酸钙、总黄酮、总皂苷、总生物碱、多糖类以及蛋白质、尿苷、腺苷、胸腺嘧啶核苷、鸟苷、次黄嘌呤、夏佛塔苷、异夏佛塔苷、肌苷的含量进行研究.结果 加入白矾炮制的样品草酸钙针晶结构发生明显变化;加少量白矾浸泡样品草酸钙针晶含量最高,单纯加大量白矾煎煮最低;总黄酮的含量生天南星最高,长时间浸泡含量最低;总皂苷的含量生
目的 根据现有临床资料系统评价紫龙金片辅助铂类为基础的化疗方案治疗肺癌的疗效和安全性.方法 计算机检索中国知网(CNKI)、维普(VIP)、中国生物医学文献数据库(CBM)、万方医学网(Wanfang)、中国临床试验注册中心、PubMed、Cochrane Library、 EmBase等数据库,检索时限从建库起至2021年5月,根据预先制定的纳排标准,纳入所有紫龙金片联合铂类为基础的化疗方案治疗肺癌的随机对照试验(randomized controlled trial,RCT),由2名研究人员独立筛选文
目的 对越南金花茶Camellia insularis化学成分及表型性状进行分析,明确其化学成分差异及基于表型性状的亲缘关系,为越南金花茶种质分类和良种选育提供依据.方法 采用超高液相色谱法建立样品化学指纹图谱,目测和直尺观测表型性状,基于液相色谱峰数量和面积,采用主成分分析、相关分析和聚类分析方法,对越南金花茶化学成分差异及亲缘关系进行评价.结果 主成分分析结果表明,以色谱峰数量为评价指标,YN3-78、YN3-77、YNX3-15、YN3-72、YN3-62等综合评分较高;以色谱峰面积为评价指标,YN
目的 制备共聚维酮-泊洛沙姆姜黄提取物固体分散体[PVP/VA-Poloxamer-Curcumae Longae Rhizoma extract (CLRE)solid dispersion (SD),PAP-CSD]、共聚维酮姜黄提取物固体分散体(PVP/VA CLRE solid dispersion,PA-CSD)、泊洛沙姆姜黄提取物固体分散体(Poloxamer-CLRE solid dispersion,P-CSD),增加CLRE在水中的溶解度和体外溶出度,改善SD的稳定性和吸湿性.方法 应用
目的 建立参贝止咳颗粒中重楼皂苷Ⅶ、Ⅵ、Ⅰ及白花前胡甲素、白花前胡乙素、白花前胡素E、法卡林二醇、人参炔醇、柚皮芸香苷、橙皮苷、川陈皮素、橘红素的高效液相色谱(HPLC)一测多评(quantitative analysis of multi-components by single-marker,QAMS)方法,并结合聚类分析和主成分分析对参贝止咳颗粒进行综合质量评价.方法 采用Venusil XBP C18色谱柱;乙腈-0.1％磷酸水溶液为流动相,梯度洗脱;检测波长分别为203 nm(检测重楼皂苷Ⅶ、Ⅵ
目的 基于数据挖掘和网络药理学,探究内服中药治疗痔疮的用药规律及关键中药的作用机制,为痔疮的临床治疗和研究提供参考.方法 检索相关数据库、书籍中的有关方剂,建立中药治疗痔疮数据库.通过Microsoft Office Excel 2017统计中药的性味、归经,利用Cytoscape 3.7.2软件筛选主要中药.利用IBM SPSS Modeler 18.0软件分析主要中药关联规则;利用IBM SPSS Statistics 23.0软件进行主成分分析.运用TCMSP、Uniprot、Genecards、D
目的 建立虎杖Polygonum cuspidatum的HPLC指纹图谱,研究虎杖醇提物的HPLC指纹图谱与抗痛风性关节炎活性之间的谱效关系,初步明确虎杖抗痛风性关节炎主要活性成分.方法 采用HPLC法建立虎杖的指纹图谱;使用“中药色谱指纹图谱相似度指纹评价系统(2004 A版)”进行相似度评价;以小鼠足垫厚度、血清尿酸含量为虎杖抗痛风性关节炎作用药效指标,采用灰色关联度分析法分析其谱效关系.结果 虎杖发挥抗痛风性关节炎作用是多种成分共同作用的结果,对抗痛风性关节炎作用贡献较大的特征峰有7号峰(虎杖苷)、
目的 探析并比较野生甘松Nardostachys jatamansi与仿野生栽培甘松的根际细菌与内生细菌的种群组成、丰富度、多样性及差异性.方法 以野生甘松和仿野生栽培甘松的根际土壤、根及根茎为研究样本,基于Illumina MiSeq第二代高通量测序技术对根际土壤细菌、根及根茎内生细菌的16S rDNA V4-V5区进行序列测定,并进行相关生物信息学分析.结果 各组样本基因组经16S测序,细菌群落的所有序列分别进行97％的相似水平下的物种分类单元(operational taxonomic units,