基于上下文环境和句法分析的蛋白质关系抽取

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针对蛋白质交互作用关系(PPI)抽取方法中特征利用的片面性问题,提出了一种从上下文环境和句法结构中抽取特征的方法。该方法抽取词法特征、位置特征、距离特征、依存句法特征和深层句法特征等丰富特征构成特征集,并且使用支持向量机(SVM)分类器进行PPI抽取。方法在5个公开的PPI语料上进行了评估。实验结果表明,丰富特征有效地利用了更为全面的信息,避免丢失重要特征的危险,得到了较好的PPI抽取性能。即在AImed语料上的实验取得了59.2%的F值和85.6%的曲线下面积(AUC)值。
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