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针对传统水位流量关系曲线拟合过程中存在精度不高的问题，应用遗传程序拟合水位流量关系。该方法能够通过演化计算自动寻找最优的模型结构，比起传统统计方法具有较大的灵活性和智能性，避免了预先假定具体数学表达式的不足。将基于遗传程序的水位流量关系模型同基于最小二乘法、遗传算法以及蚁群算法的模型进行详细比较，实例表明，基于遗传程序设计的水位流量关系模型适应性强，拟合精度最高，为水位流量关系拟合提供了新的有效方法。