【摘 要】
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以贵州宗地花猪和贵州从江香猪2个地方猪种为研究对象,构建基因组DNA池,扩增GDF9基因第1外显子和第2外显子序列,采用直接测序法对2个品种的GDF9基因进行单核苷酸多态性进行检
【机 构】
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贵州大学动物科学学院; 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室; 贵州省农业委员会;
【基金项目】
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贵州省科技厅农业攻关项目(20123013,20127032)资助
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以贵州宗地花猪和贵州从江香猪2个地方猪种为研究对象,构建基因组DNA池,扩增GDF9基因第1外显子和第2外显子序列,采用直接测序法对2个品种的GDF9基因进行单核苷酸多态性进行检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对GDF9基因m RNA二级结构、蛋白质二级结构的影响。结果表明,在2个品种中共检测到T997A、C1009T、T1014C、G1137T和A1196T 5个SNPs位点,其全位于第二外显子上。T997A、C1009T和A1196T均为错义突变。T997A导致编码的苯丙氨酸(Phe)变为异亮氨酸(Ile)、C1009T导致编码的亮氨酸(Leu)变为苯丙氨酸(Phe)、A1196T导致编码的赖氨酸(Lys)变为甲硫氨酸(Met)。SNPs位点对于GDF9基因的m RNA二级结构、蛋白质二级结构有一定影响。
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