【摘 要】
：
目的 探讨副溶血弧菌VP0350基因编码蛋白CalR的结构和功能. 方法 从NCBI GenBank数据库中获取VP0350基因及其编码蛋白CalR序列;利用ExPASy服务器中的ProtParam及ProtScale预
【机 构】
：
潍坊医学院医学检验学系,山东潍坊261053;解放军第九六○医院实验诊断科
论文部分内容阅读
目的 探讨副溶血弧菌VP0350基因编码蛋白CalR的结构和功能. 方法 从NCBI GenBank数据库中获取VP0350基因及其编码蛋白CalR序列;利用ExPASy服务器中的ProtParam及ProtScale预测CalR蛋白的一般理化性质及亲疏水性;利用TMHMM Server v.2.0及SignalP 4.0 Server分析CalR蛋白的跨膜区及信号肽;利用SOPMA分析CalR蛋白的二级结构并利用Phyre 2 sever对其进行蛋白质三级结构同源模型构建;利用NCBI的CDD(Conserved Domain Database)数据库,NetPhos 3.1Server及STRING 11.0对CalR蛋白的结构域,磷酸化位点和相互作用蛋白进行预测分析. 结果 副溶血弧菌VP0350基因编码的CalR蛋白由319个氨基酸构成,相对分子质量为36.192 34×103,理论等电点(pI)为6.20,为不稳定的亲水蛋白,无信号肽和跨膜螺旋区,二级结构中主要为α-螺旋,并成功构建三级结构模型.CalR蛋白具有1个保守结构域和多个磷酸化位点,并具有多个相互作用蛋白. 结论 生物信息学方法预测CalR蛋白为亲水性蛋白,含有抗原表位区域,可为副溶血弧菌感染的表位疫苗研究提供参考依据.
其他文献
本文由磁的库仑定律推导出矩形均布磁荷体系中任一磁荷所受到的磁力,从而得出了方钢纵向磁化时端面上的磁力分水岭(磁力从指向矩形的一边变为指向另一边的分界线)和磁荷分水
字幕处理是非线性编辑所有功能中最重要的部分,文章从课程简介、个人理解、学法介绍三个主要方面,对说课进行设计。鼓励开放式教学思路,注重对学生自学能力的培养,为今后的实
根据工件磁化时表面缺陷凸棱线上的磁荷分布本文证明:工件表面大方孔周围有时也会出现由孔角开始沿45°线向外延伸的长直线状磁痕,这一推论不仅得到1995年夏所作磁粉探伤试验
目的 调查医院污水中多重耐药菌污染情况及其耐药基因和Ⅰ类整合子携带情况. 方法 采集河南省郑州大学第一附属医院污水,使用16S rRNA测序和微量生化反应管鉴定细菌种属;采用
目的 分析怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒血凝素(HA)基因的遗传变异特征. 方法 选取怀柔区2013年9月-2018年8月50株甲型H3N2流感病毒,进行HA基因扩增和测序,运用MEGA6.0
本文简要介绍了漏磁检测的基本原理,给出了表面裂纹漏磁场的有限元模拟分析方法,研究了表面裂纹深度变化时漏磁场的分布规律.文中还对简单的矩形裂纹漏磁场进行了解析计算,对
按照矩形钢件的纵向磁化原理(磁荷必均匀地分布在试件的所有棱线上),本文给出了工件表面矩形沟槽引起漏磁场的近似解析表达式,并通过数值计算绘出了沟槽对称轴上的磁场空间分
本文通过对管道缺陷漏磁信号特征的分析,采用差分阈值和动态范围阈值对数据重要性进行判断.并提出了两种分别采用差分值霍夫曼编码和小波变换编码实现检测无损压缩的方法.
本文简要概述了漏磁定量检测的原理.由于小波分析具有识别突变信号的特点,文中利用小波分析有效地识别出裂纹存在的位置,并通过仿真及计算获得了满意的效果.文中还用人工神经
简介:这是参加丽水市英语技能竞赛服务类比赛的职业风采展示英语剧本,主要目的是展现我们中职学生的专业技能。本文开始部分是空姐讲解飞机起飞时的注意事项;而后,在飞行过程