【摘 要】
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目的探讨分析先天性小耳畸形差异性长链非编码RNA(lnc RNA)的表达谱与生物信息学分析。方法采用Arraystar高通量lnc RNAs基因芯片研究3例先天性小耳畸形的患者的小耳侧残耳软
【机 构】
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北京协和医学院中国医学科学院整形外科医院整形七科;
【基金项目】
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北京市自然基金(7132176);协和青年基金(33320140171);国家自然科学基金(81272124,31040031)
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目的探讨分析先天性小耳畸形差异性长链非编码RNA(lnc RNA)的表达谱与生物信息学分析。方法采用Arraystar高通量lnc RNAs基因芯片研究3例先天性小耳畸形的患者的小耳侧残耳软骨与正常侧耳软骨,获得lnc RNAs差异性表达谱。结果本实验所用的基因芯片包含30 586个lnc RNAs和26 109个m RNAs探针;与正常侧软骨比较,残耳软骨共检测出差异性表达Lnc RNAs共有180条,其中表达上调的Lnc RNAs有74条,表达下调的Lnc RNAs有106条。信号通路分析显示涉及到甘油酯类代谢、破骨细胞分化、肿瘤生长等。结论先天性小耳畸形存在明显的lnc RNAs差异性表达,这些lnc RNAs及某些信号通路可能在小耳畸形发生和发展中发挥重要作用。
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