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采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对云南穗花杉(Amentotaxus yunnanensis)4个居群和台湾穗花杉(Amentotaxus formosana)1个居群共104个个体进行了遗传多样性分析.9个随机引物共扩增出清晰谱带143条.云南穗花杉在物种水平上遗传多样性较高(多态位点百分率P为79.0%,基因多样性指数He为0.2718),但云南穗花杉和台湾穗花杉居群内遗传多样性均较低(P为18.0%、6.9%;He为0.0688、0.0198).云南穗花杉居群间遗传分化强烈(AMOVA,Gsr