【摘 要】
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目的初步研究限制性显示技术(RD-PCR)作为一种高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法对芯片杂交信号的影响.方法收集3个健康人外周血单核细胞,提取RNA后分为两组,采用RD-PCR进
【机 构】
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南方医科大学基因工程所,湖南师范大学生命科学院
【基金项目】
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grant for Establishment of Key Biochip Laboratory from Guangdong Province;
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目的初步研究限制性显示技术(RD-PCR)作为一种高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法对芯片杂交信号的影响.方法收集3个健康人外周血单核细胞,提取RNA后分为两组,采用RD-PCR进行样本双色(Cy3/Cy5)荧光标记,与3张Agilent 60 mer高密度(22 K)人1B寡核苷酸芯片进行杂交.排除阴性和阳性对照信号值、Cy3和(或)Cy5的前景与背景间无统计显著性差异点的信号值,进一步排除两种荧光标记间存在统计显著性差异点的信号值,将3张芯片的共同信号值用于分析.SPSS软件进行常规统计分析和作图,R语言环境下的VSN统计包排除芯片间和两种不同荧光标记间的系统误差.结果 3张芯片的8744个共同点用于本研究.芯片间及两种荧光标记间存在明显的可校正的系统误差.芯片间杂交信号值相关显著.RD-PCR样本标记方法对较低表达基因信号值较为敏感.结论初步的统计分析结果表明,RD-PCR是一种潜在的有用的高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法.
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