【摘 要】
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目的:运用网络药理学与生物信息学方法构建“疾病-基因-靶点-成分-药物”网络以探索小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和信号通路.方法:基于高通量基因表达(GEO)数据库筛选哮
【机 构】
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辽宁中医药大学附属医院,沈阳110032;辽宁中医药大学,沈阳110847
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目的:运用网络药理学与生物信息学方法构建“疾病-基因-靶点-成分-药物”网络以探索小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和信号通路.方法:基于高通量基因表达(GEO)数据库筛选哮喘与健康人差异基因,通过TCMSP数据库检索小青龙汤中药物活性成分,筛选疾病基因和药物成分靶点作为交集基因,采用R语言,Cytoscape3.7.2软件中不同软件包分别对交集基因进行蛋白互作(PPI)分析,基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:GEO数据库中编号为Series GSE43696符合研究要求,内含108张芯片数据,通过筛选得到差异表达基因820个;小青龙汤中共含有活性成分169个,对应作用靶点246个;通过小青龙汤靶基因与疾病基因取交集共获得25个交集基因;PPI网络结果提示91个靶点可能参与小青龙汤作用机制中;GO富集分析共涉及包括氧化应激、炎症反应、细胞外基质调控、血管内皮生长因子功能调控在内的180条基因功能;KEGG富集分析共获得包括辅助性T细胞17(Th17)分化调控,白细胞介素-17(IL-17),肿瘤坏死因子(TNF),低氧诱导因子-lα(HIF-la)在内的39条信号通路.结论:小青龙汤在哮喘干预中体现了多成分、多靶点、多通路特征,该研究结果可为小青龙汤机制挖掘提供重要依据.
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