基于相对熵的蛋白质设计新方法

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【摘要】

：

提出一个关于蛋白质设计的新的有效快速的优化方法, 其实质是按照Boltz-mann分布搜索序列空间. 这一方法完全基于物理学原理, 在该方法中使用了相对熵的概念, 并把它作为优化

【作者】

：

刘贇王宝翰王存新陈慰祖

【机构】

：

北京工业大学生命科学与生物工程学院,中国科学院生物物理研究所

【出处】

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中国科学G辑

【发表日期】

：

2004年期

【关键词】

：

蛋白质设计相对熵非格子模型

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提出一个关于蛋白质设计的新的有效快速的优化方法, 其实质是按照Boltz-mann分布搜索序列空间. 这一方法完全基于物理学原理, 在该方法中使用了相对熵的概念, 并把它作为优化的目标函数. 利用真实蛋白质的非格子模型对该方法进行了检验. 与同类工作相比, 得到了较好的结果. 该方法可以作为处理蛋白质折叠和逆折叠的统一框架.

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