【摘 要】
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目的 通过全基因组序列分析南宁市1株人感染高致病H7N9禽流感病毒的分子遗传特性. 方法 不明原因肺炎患者1例,采集其下呼吸道痰液,经荧光RT-PCR检测H7N9核酸阳性后送中国疾病
【机 构】
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南宁市疾病预防控制中心,广西南宁,530023
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目的 通过全基因组序列分析南宁市1株人感染高致病H7N9禽流感病毒的分子遗传特性. 方法 不明原因肺炎患者1例,采集其下呼吸道痰液,经荧光RT-PCR检测H7N9核酸阳性后送中国疾病预防控制中心分离病毒并应用illumina平台深度测序,用MEGA5.1进行同源性和重要氨基酸位点分析,采用Neighbor-Joining法构建进化树.结果 分离毒株命名为A/Nanning/01/2017 (H7N9),测序分析该毒株的8个基因与A/chicken/Heinan/ZZ01/2017(H7N9)和A/Guangdong/HP001/2017(H7N9)高度同源.其中,HA蛋白裂解位点由PEIPKGR↓GLF突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,具有高致病性的分子特征;受体结合位点G186V发生变异,毒力相关位点D225G发生突变,糖基化位点保守,飞沫传播关键氨基酸158D/224K/226L、110Y/160A/226L/228S和196R/226L/228S任一组合未发生突变.NA蛋白茎杆区丢失5个氨基酸,糖基化位点和耐药性位点保守.M2蛋白耐药性位点V27G和S31N发生突变.PB1蛋白I368V位点,PA蛋白K356R位点,M1蛋白N30D位点和T215A位点及NS1蛋白P42S位点均发生突变.PB2蛋白关键氨基酸位点E627K和D701N未突变. 结论 生物信息学分析A/Nanning/01/2017 (H7N9)毒株可能来源于珠三角地区禽类的感染,具有高致病性禽流感病毒的分子特征,但未发现二代传播,人传人的可能性不大.该毒株对神经氨酸酶抑制剂药类敏感,对M2离子通道抑制剂可能产生耐药性.
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