在人类胰腺癌细胞BxPC3全基因组中受Notch-1胞内结构域和CBF-1转录共调控的靶基因特征分析

来源 :首都医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wuzhenlikk

【摘要】

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目的在人类胰腺癌细胞BxPC3全基因组水平上寻找受Notch-1胞内结构域和CBF-1共同转录调控的靶基因；分析它们的类型、功能和在基因组中的分布等特征值；并以此为基础预测Notch信号

【作者】

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王澜舸张玉祥

【机构】

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首都医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系

【出处】

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首都医科大学学报

【发表日期】

：

2014年2期

【关键词】

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Notch信号通路 CBF-1 染色质免疫共沉淀高通量测序峰值基因聚类分析 Notch signalling pathway CBF-1 chroma

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目的在人类胰腺癌细胞BxPC3全基因组水平上寻找受Notch-1胞内结构域和CBF-1共同转录调控的靶基因；分析它们的类型、功能和在基因组中的分布等特征值；并以此为基础预测Notch信号通路的潜在生物学功能和调控模式。方法染色质免疫共沉淀联合基于Illumina/Solexa平台的高通量测序。结果1）Notch-1胞内结构域和CBF-1两组样本有效read数分别为14287722和14289280个,与人类参考基因组唯一匹配的read数分别为11782027和11711920个；2）两组样本的peak数分

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