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作为一种新型分子标记，表达序列标签一简单重复序列（EST—SSR）来自表达基因，因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外，还与基因功能表达具有直接或间接的关系，从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记的开发策略、方法及其应用进展，总结了其中存在的一些问题，目的是为今后该领域的研究提供一定的参考。