基因组水平上水稻受体激酶基因家族的生物信息学分析

来源 :中国农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maly_soly
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
对已完成全序列分析的籼稻(北京基因组信息中心,B GI)和接近完成全序列分析的粳稻(国际水稻基因组测序计划,IRGSP)的蛋白质数据库进行两步HMM(hidden ma rkov model)模式匹配搜寻,在基因组水平上分别获得籼稻和粳稻受体激酶5个基因家族的成员序列共6 4 3和7 01个,对粳稻受体激酶进行了详细的生物信息学分析.对粳稻和籼稻的同源比较分析表明,受体激酶基因存在非常强的保守性,但不同基因在基因组水平上可能存在不同水平的扩增.对Swissprot数据库的同源分析表明,这些基因是植物特有的
其他文献
从棉铃虫触角中克隆了一条全长722bp的cDNA序列,命名为CSPHarm. CSPHarm阅读框全长381bp,编码127个氨基酸残基,推导的氨基酸序列具有昆虫化学感受蛋白的典型特征.CSPHarm与已