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通过对果蝇pol Ⅱ启动子和非启动子的序列特征分析，计算了序列每个位点单碱基保守性M1（l）值和六联体保守性M6（l）值。从而分别选取两个区域的六联体频数作为离散源参数，利用离散增量结合二次判别函数（IDQD）对启动子进行了预测。对于从编码区和内含子中选取的非启动子数据集，启动子的预测成功率分别达到93％和89％。比较结果显示InQD模型能够有效地提高启动子预测成功率。