球毛壳菌部分表达序列标签的生物信息分析

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【摘要】

：

球毛壳菌属于子囊菌门，是一种植物病害的广谱生物防治菌。为了解球毛壳菌的遗传背景和为生产上的应用打下基础，构建了球毛壳菌菌丝体的cDNA文库。测序产生了3507个可读序列，进一

【作者】

：

金红星杨谦

【机构】

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哈尔滨工业大学生命科学与工程系哈尔滨150001

【出处】

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高技术通讯

【发表日期】

：

2004年7期

【关键词】

：

球毛壳菌生物信息生物防治菌 ESTS cDNA文库子囊菌

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球毛壳菌属于子囊菌门，是一种植物病害的广谱生物防治菌。为了解球毛壳菌的遗传背景和为生产上的应用打下基础，构建了球毛壳菌菌丝体的cDNA文库。测序产生了3507个可读序列，进一步分析时去掉小于100bp的短序列。用phrap软件对所获得的3116个表达序列标签(EsT)进行拼接，生成387个contigs和1023个singlets。BLAST分析表明513个单一基因是已知基因，897个单一基因代表新基因。通过E-mail从国际DNA数据库(DDBJ)取得了1410条序列的登录号。从已知基因中鉴定了3类生物

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