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质谱（mass spectrometry）技术是一种测量离子荷质比（电荷-质量比）的分析方法，可用来分析同位素、元素成分及有机物构造等。质谱仪最早的临床应用主要在于检测一些生物标记物以帮助诊断癌症和遗传疾病等。20世纪80年代，日本岛津公司的田中耕一发明了基质辅助激光解析电离（ma-trix assisted laser desorption ionization，MALDI）技术，使得质谱能够检测生物大分子[1，2]，该发明在2002年荣获诺贝尔奖。质谱技术的诞生和发展奠定了用蛋白质指纹图谱鉴定微生物的基础，通过检测未知微生物的蛋白质指纹图谱并与质谱图数据库中特征性谱图进行比对，从而对待测微生物进行快速鉴定。由于测定的图谱中主要的分子离子峰为菌体内高丰度，且表达稳定、进化保守的核糖体蛋白，因而此法不但鉴定结果精确度高，且能借助聚类剖析获取微生物间的进化与亲缘关系。