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红色基因传承是关系到国家长治久安的系统工程,需要对红色基因传承问题进行系统认知。以东方特色的物理—事理—人理系统方法论对红色基因传承进行分析,认为红色基因传承的“物理”表现为红色基因及其传承特性、遗传和变异机理;“事理”表现为战略层面的顶层设计和战术层面的高校主导的微观运作;“人理”表现为利益相关者的价值诉求和主体能动性,以此构建基于物理—事理—人理系统方法论的红色基因传承路径,以指导红色基因传承实践活动。