【摘 要】
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目的：基于生物信息学分析六味地黄汤治疗肾纤维化的分子机制并验证。方法：从美国国家生物技术信息中心（NCBI）旗下的基因表达数据库（GEO）获得包含29个正常肾组织和23个肾纤维化组织的基因芯片数据集GSE12682和注释文本GPL571，使用Strawberry Perl和R软件筛选肾纤维化差异表达基因（DEGs）。通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获得六味地黄汤中六味药的成分表和作
【基金项目】
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湖南省教育厅项目（编号：21A0242;20C1398）； 湖南省自然科学基金项目（编号：2021JJ30506）； 长沙市自然科学基金项目（编号：kq2014089）； 湖南中医药大学校级科研基金（编号：2020-27）；
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目的：基于生物信息学分析六味地黄汤治疗肾纤维化的分子机制并验证。方法：从美国国家生物技术信息中心（NCBI）旗下的基因表达数据库（GEO）获得包含29个正常肾组织和23个肾纤维化组织的基因芯片数据集GSE12682和注释文本GPL571，使用Strawberry Perl和R软件筛选肾纤维化差异表达基因（DEGs）。通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获得六味地黄汤中六味药的成分表和作用基因靶点。使用Strawberry Perl整合出两者的交叉靶点，并用Cytoscape软件和R软件制作蛋白质－蛋白质相互作用（protein-protein interaction，PPI）网络，利用STRING网站进行基因本体（GO）生物功能分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。实验验证，12只SD雄性大鼠随机分为正常对照组、模型对照组、依那普利组和六味地黄汤组，HE染色、Masson染色观察各组肾组织病理改变，免疫组化法检测各组肾组织血管内皮生长因子信号A（VEGFA）、血管内皮生长因子信号受体1（VEGFR1）两种蛋白的表达量差异。结果：通过疾病、药物取交集靶点得到六味地黄汤针对肾纤维化的26个基因靶点；GO提示这些基因影响2种细胞组分、210条生物过程；KGEE表明关键相关通路为血管内皮生长因子信号（VEGF）信号通路、ERBB信号通路、FcεRI信号通路、白介素-17（IL-17）信号通路等。验证试验表明，与正常对照组相比，模型对照组肾组织胶原容积分数增加，VEGFA和VEGFR1蛋白表达明显下调（P＜0.05）；与模型对照组相比，六味地黄汤组肾组织胶原容积分数降低，VEGFA和VEGFR1蛋白表达上调（P＜0.05）。结论：六味地黄汤可通过多基因靶点、多信号通路治疗肾纤维化，其中上调VEGF信号通路是其抗纤维化重要分子机制。
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