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目的：了解许昌市2011-2013年手足口病重症病例病原体型别和分布特征。方法采集2011-2013年间许昌市本地手足口病重症病例的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液标本，采用Real-Time RT-PCR法进行病毒核酸检测。结果共采集479例手足口病重症病例临床标本进行检测，检测阳性308例，阳性率64.30%。其中E V71阳性220例，阳性率45.93%；C A16阳性30例，阳性率6.26%；其它肠道病毒阳性58例，阳性率12.11%。不同年份E V71、C A16和其它肠病毒构成不同(χ2=12.537，P＜0.05)。结论手足口病重症病例主要由EV71引起；不同流行年份，病原构成不同。