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根据中共中央国务院关于事业单位改革文件要求,明确指出事业单位改革时间表,从事生产经营活动的军工科研事业单位,最晚到2020年将转制为企业。财务管理作为企业的一项重要职能,如何在转型过程中进行相应财务变革至关重要。本文拟从财务角度分析军工科研事业单位财务管理现状与风险问题,探析军工科研事业单位在转型过程中应在几个方面进行实质性的变革从而有效应对转型工作。