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为筛选薏苡种仁内生真菌的抗菌活性，采用组织分离法，从禾本科黍亚科蜀黍族薏苡种仁中分离内生真菌，采用菌饼法筛选其抗菌活性。通过5．8 S ITS 分子系统学鉴定菌种，高效液相色谱法（HPLC）分析鉴定菌种发酵液正丁醇提取物次的生代谢产物。结果表明：分离共获得23株薏苡种仁内生真菌，其中，有弯孢霉属、链格孢属、砖孢属、茎点霉属、灰软盘菌属、稻黑孢属、玉蜀黍赤霉属、曲霉属及其他真菌。57％的菌株至少对测试菌株中的1种具有抗菌活性，且 GZR19号菌株具有广谱抗菌活性并鉴定为1种茎点霉（Phoma sp ．），其发酵液的次生代谢产物在该色谱条件下主要有4种物质含量较高，其中可能存在具有抗菌活性的化合物。