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生态系统是生物多样性的重要组成部分，更是物种多样性和遗传多样性赖以维持和保存的基础。为了有效地保护准噶尔盆地区域内的生态系统，综合应用生态学理论、植被长期研究成果和地理信息系统技术，总结了准噶尔盆地内生态系统类型，分析了各类生态系统特征和空间分布规律，探索了一种生态系统保护优先性评价方法，以期为区域生态保护建设提供依据。