节旋藻硝酸盐转运蛋白基因Amnrt P序列分析

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应用生物信息学软件对获得的节旋藻硝酸盐转运蛋白基因(AmnrtP)全长序列进行了结构特征、同源性比较、多序列比对、系统发育学分析等。结果表明:该基因全长为1515个核苷酸,编码504个氨基酸,平均GC含量为43.8%,疏水氨基酸的比例为47.6%。该硝酸盐转运蛋白含有12个跨膜结构域(Transmembrane domains,Tm),膜拓扑结构与NRT2家族的类似,并发现了多个NRT2家族的保守序列。同源性搜索显示与属于NRT2基因家族的海洋蓝藻的氨基酸序列相似性为75%~89%。采用邻接法(NJ)、最
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