消化机能的整体性指消化系统各器官的功能在调节系统的整合作用下，形成一个整体，不仅各段消化道之间，而且各消化功能之间都相互联系，相互制约，完成整个消化过程。同时，消化系统是机体的一个组成部分，与其他系统保持着紧密联系、相互协调的关系，以维持生命活动的正常进行。
　　1 各器官间的相互关系
　　各消化器官和消化过程的联系消化活动不论在各段消化道之間，还是各消化过程之间，都存在着相互联系和相互制约的关系。消化道受到刺激往往会引起一系列消化活动的连锁性反应，一般表现为后段消化活动加强和前段消化活动减弱或抑制。
　　进食动作可引起唾液分泌和胃肠道活动的加强，为随后的食物进入和消化作好准备。胃肠之间也存在明显的反射性联系，食物充满胃内，加强肠道的分泌和运动机能，甚至引起排粪反射。反之，刺激肠内感受器，会反射性抑制胃的运动和分泌。刺激盲肠压力感受器则引起小肠运动的抑制。
　　至于各消化过程之间存在更为复杂的相互联系，不但存在神经反射，还有激素的作用。例如，胃腺分泌的盐酸对于食靡由胃向肠内排空起着调节作用。盐酸由胃入肠，作用于小肠黏膜产生促胰液素和缩胆囊素，能促进胰液和胆汁分泌以及胆管系统的运动和释放胆汁。盐酸还能刺激小肠黏膜产生缩肠绒毛素，促进小肠绒毛运动，加速营养分的吸收。消化道的微生物作用受其他消化过程的制约，例如，瘤胃的内环境受唾液分泌、瘤胃运动及排空等消化机能的调节，从而保证微生物的繁殖和他的消化代谢作用。由此可见，各消化过程之间，分泌与运动、分泌与分泌、分泌与吸收、甚至分泌与微生物之间都存在密切的联系。
　　2 营养物质在消化管与循环血液之间的交换
　　消化器官除完成基本的消化和吸收机能以外，还通过消化液分泌从血液透过大量水分、含氮物质、矿物质以及其他营养物质，而这些物质大部分又在消化管内被重新吸收入循环血流，从而实现营养物质在消化管与循环液之间的交换，在机体的中间代谢中其着重要作用。
　　农畜分泌大量消化液，唾液、胃液、胰液、胆汁、肠液，合计一昼夜猪达30～45升，马190～200升，牛180～200升，绵羊15～40升。这些消化液含电解质浓度与血浆大致相同。消化液随食靡通过消化管时，大部分被肠管所重吸收，因此，水分和电解质在消化管与循环血液之间不断地进行循环。
　　以牛为例，一昼夜所分泌的消化液，如果与血液总量比较，循环血液水分部分与消化管间完成循环10次之多。猪为5～8次。不但血液与消化液的水分进行交换，同时组织液与血液的水分也进行交换。对装置肠体外吻合瘘管的牛研究表明，一昼夜间通过十二指肠的食靡内，含矿物质良远远超过所摄取饲料内的含量。例如，磷、纳、氯、钾和钙随消化液排入，一昼夜共达1 000～1 500克。随后这些物质也在肠内被从新吸收。
　　随消化液分泌的内源蛋白质，牛一昼夜达500～700克，在消化过程中生成的氨基酸，大致同随饲料吃入的良相等。5～7月龄的猪在喂以谷物饲料时，一昼夜随消化液排出内源氮5～40克。牛由胃进入小肠的粗脂肪，比所采食的饲料内含量多0.5～1.0倍。除了一部分由于微生物因素外，其余与消化液分泌有关。粗脂肪的65%脂肪酸，其中含有许多高分子脂肪酸，在肠内被吸收，可能对乳牛的脂肪代谢有密切关系。
　　随消化液分泌的内源性物质，不但对于机体的营养过程有着重要的影响，而且对于维持机体正常的生理状态也是不可缺少的。反刍动物流失十二指肠食靡，数小时后消化活动就出现紊乱，长时间没有反刍和食欲消失。由于丧失大量水分、有机物和矿物质，出现血液浓缩，血内矿物质含量减少，机体内环境平衡遭到破坏。
　　当动物由于患消化道疾病发生腹泻或呕吐时，机体流失不同比例的消化液，使水分和电解质大量丢失，造成失水，电解质和酸碱平衡失调，所以这时需要输液进行治疗。
　　在饥饿的动物，仍随消化液排出大量的蛋白质、矿物质等内源性物质。这一过程可认为是机体动员身体组织的营养储备，通过消化道转运，以维持重要器官的营养需要和生理机能，是机体抵抗饥饿、延长生命的一种重要的适应性反应。